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本区在动物地理区划上属于古北界─东北亚界─东北区─长白山亚区,野生动物区系介于大兴安岭和长白山地之间,区系组成比较丰富。据多年的调查研究与标本采集统计,本区共有昆虫类11目72科491种,鸟类16目46科252种,兽类6目16科44种,两栖类2目4科5种,爬行类2目3科7种,冷水鱼类20余种。土壤动物51类,隶属于4门8纲21目39科。
本区除有多种食虫、食鼠和传播树木种子的鸟、兽以外,还有许多可直接利用的经济动物资源。其中有原麝、马鹿、棕熊、黑熊、飞鼠等名贵的药用动物40多种,有紫貂、黄喉貂、黄鼬、水獭、松鼠、麝鼠等珍贵的毛皮动物20多种,有东北兔、狍、花尾榛鸡、中国林蛙、黑龙江林蛙 、细鳞鱼、哲罗鱼等美味的食用动物30余种。
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