理学院紧紧围绕学校“丰富内涵、注重创新”的办学理念和“本科教学为基础，师资队伍建设为核心，以质量求生存，以特色求发展”的办学思路，结合理学院教学的特点，确立了学院的教学工作思路：
    夯实基础、注重创新、培养高素质人才
    确立学校的基础课教学和理学院的本科专业教学的中心地位，进一步加强学科建设，提升研究生教育。
    逐步建立基础课教学与大学生创新能力（意识）培养相结合的教学体系。建设高素质教师队伍，确保本科教学质量的全面提升。努力提高科学研究水平，促进对大学生创新能力的培养。
    理学院根据人才培养的特点和要求，与中学、企业和公司等单位建立了人才培养实习基地共15个，为培养实践型、综合型创新人才建立了良好的平台。
    理学院实验教学中心下设两个分中心，六个实验室及一个微机室，其中化学实验教学分中心为黑龙江省化学实验教学示范中心，为理学院的本科专业实验教学及学校的基础实验教学提供了良好的实验教学环境。
    理学院教师在以教学为中心的前提下，积极从事教学研究工作，近五年来，承担国家级教改项目2项、省级教改项目8项和校级教改项目15项，共25项。共获省级教学成果一等奖1项、省级教学成果二等奖4项，教学成果已推广到实际的教学之中。
    课程与教材建设有了显著的提高，42%的课程采用多媒体教学，黑龙江省精品课程1门、校级精品课程1门、校级优质课程7门，出版教材18部，其中4部为校优秀教材。同时理学院承担国家自然科学基金、省杰出青年科学基金、“948”项目、省攻关重点项目等研究项目30项，理学院以科研带动教学，科学研究促进了本科教学的提升。
    理学院将重点培养国家级、省级教学名师和精品课程，形成学院的特色教学和精品教学。